我正在研究一個F-box蛋白被敲除的擬南芥突變體。已經表明,必須首先將F-box蛋白靶標磷酸化( Skowrya等,1997)。我聽說過磷酸化位點,但我無法確定每種蛋白質是否都有它們。可以將任何蛋白質磷酸化嗎?
我正在研究一個F-box蛋白被敲除的擬南芥突變體。已經表明,必須首先將F-box蛋白靶標磷酸化( Skowrya等,1997)。我聽說過磷酸化位點,但我無法確定每種蛋白質是否都有它們。可以將任何蛋白質磷酸化嗎?
磷酸化只能發生在特定的氨基酸上,即所謂的磷酸化位點。這些氨基酸是Ser,Tyr,Asp,Thr和His。理論上,這些氨基酸中的任何一種都可以被磷酸化,但實際上,由於多種原因,它實際上可能不會出現。其中一些是由於蛋白質總電荷的變化會影響3D構象,或者氨基酸無法通過特定的激酶等獲得。如果您要求進行蛋白質印跡,請參見抗體說明書表格應指出是否存在磷酸化形式,並應參考描述這種修飾的文獻。
其他答案中缺少一個重要的事情:不僅磷酸化只會發生在選定的氨基酸上,而且不會發生在所有氨基酸上。
因此,並非所有的Ser / Thr /蛋白質的Tyr可以被磷酸化,因為它們在結構上可能無法被蛋白激酶接近,並且它們必須處於特定的基序才能被磷酸化。
人類蛋白質參考數據庫例如,列出了許多 Tyr和 Ser / Thr激酶的磷酸化基序。
磷酸化需要暴露的絲氨酸,蘇氨酸,酪氨酸或組氨酸殘基(在真核生物中)。這是因為磷酸基團向蛋白質的轉移是由一類稱為激酶的蛋白質介導的。激酶可以具有廣泛或特定的活性。
此評論應該包含您問題的大部分答案:
我最喜歡Nico的+1。我確實找到了關於磷酸精氨酸和磷酸賴氨酸的有趣的綜述-可能的磷酸化位點列表不斷增加。正如Nico所寫和Leonardo所暗示的那樣,不僅氨基酸的空間背景被(或不被)磷酸化,而且時間上也是如此。目標蛋白和蛋白激酶是否共表達?如果您正在查看特定的組織(根,花,葉),並且所討論的激酶僅在幼苗中產生,則可能不會真正發生潛在的磷酸化。
有關蛋白質翻譯後修飾(包括磷酸化,甲基化,乙酰化,泛素化等)的最全面的數據庫之一,請查看 PhosphoSite。您可以找到指向序列,疾病,基序,出版物,抗體,質譜實驗,結構的鏈接。