Can H.
2015-02-14 03:21:16 UTC
通常，變體調用程序（例如GATK-UnifiedGenotyper）會尋找參考基因組和提交序列之間的差異。但是，我們都知道參考基因組在各個位置都包含稀有變體。如果提交的序列具有這種變體的這種罕見形式，則變體調用將看不到它，也不會報告。但是，該變體對於分析而言可能非常珍貴。
那麼，如何解決這個問題？我該怎麼辦，即使它們在參考基因組中，也不要錯過這些罕見的變異？
請不要像在這裡那樣交叉發布：http://seqanswers.com/forums/showthread.php?t=50289
謝謝你的回答。但是我為什麼不呢？我想吸引盡可能多的人。其實我在Quora上問了同樣的問題。我不認為這是錯誤的。 Seqanswers和Stackexchange是不同的平台，並且可能具有不同的用戶。因此，僅是單個平台成員的用戶可能會錯過我的問題。交叉發布增加了獲得答案的可能性。
交叉發布對您來說很方便，但可以加倍/三倍/等。社區為幫助您而花費的工作。當社區A中的人已經為您提供了問題的答案時，社區B中的人為什麼要花時間幫助您？
實際上，我將分享我在提出問題的每個平台中找到的答案。因此，兩個平台上的每個人都將學習答案。更多的人將從中受益。更好吧？